290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0525 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  100 
 
 
175 aa  362  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  88.96 
 
 
163 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  87.12 
 
 
163 aa  299  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  85.28 
 
 
163 aa  298  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  87.12 
 
 
163 aa  298  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  85.89 
 
 
163 aa  298  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  85.89 
 
 
163 aa  298  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  85.89 
 
 
163 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  84.05 
 
 
163 aa  295  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  84.05 
 
 
163 aa  295  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  84.05 
 
 
163 aa  295  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  84.05 
 
 
163 aa  295  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  84.05 
 
 
163 aa  295  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  84.05 
 
 
163 aa  295  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  84.05 
 
 
163 aa  295  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  84.66 
 
 
163 aa  293  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  84.66 
 
 
163 aa  293  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  79.14 
 
 
163 aa  272  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  77.3 
 
 
163 aa  271  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  75.46 
 
 
163 aa  268  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  74.85 
 
 
163 aa  266  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  75.78 
 
 
163 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  73.46 
 
 
166 aa  254  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  73.46 
 
 
166 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  76.13 
 
 
167 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  72.78 
 
 
164 aa  246  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  71.88 
 
 
163 aa  244  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  72.61 
 
 
166 aa  241  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  68.12 
 
 
163 aa  233  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  68.12 
 
 
187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  65.62 
 
 
161 aa  230  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  68.12 
 
 
163 aa  229  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0535  hypothetical protein  66.25 
 
 
163 aa  217  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1195  ybaK/ebsC protein  62.35 
 
 
162 aa  208  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  64.38 
 
 
160 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  66.43 
 
 
160 aa  204  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  65.73 
 
 
160 aa  202  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  61.25 
 
 
160 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  63.09 
 
 
162 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  62.42 
 
 
160 aa  193  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  63.19 
 
 
160 aa  192  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  58.55 
 
 
161 aa  191  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  60.26 
 
 
160 aa  187  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  60.93 
 
 
160 aa  185  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  56.25 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.77 
 
 
160 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2007  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.88 
 
 
163 aa  134  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  42.86 
 
 
157 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  41.22 
 
 
157 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  32.68 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  37.74 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  39.07 
 
 
157 aa  95.5  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  38.04 
 
 
163 aa  94  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  33.12 
 
 
159 aa  94  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  94  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  94  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  94  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  35.37 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  35.37 
 
 
159 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  41.01 
 
 
157 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  32.5 
 
 
159 aa  92.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  31.08 
 
 
155 aa  92  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  35.37 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  32 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  34.38 
 
 
159 aa  91.7  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  36.31 
 
 
157 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  31.76 
 
 
155 aa  91.3  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  36.49 
 
 
157 aa  91.3  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  31.87 
 
 
159 aa  90.9  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  32 
 
 
158 aa  90.9  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  32.7 
 
 
159 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  32.7 
 
 
159 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  32.7 
 
 
159 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  32.7 
 
 
159 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  32.7 
 
 
159 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  32.19 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  32.19 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  32.19 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  31.08 
 
 
158 aa  90.5  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  33.11 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  35.97 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  32.19 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  36.49 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  38.69 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  38.13 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 
156 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  33.75 
 
 
159 aa  89  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  35.26 
 
 
164 aa  88.2  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  33.56 
 
 
159 aa  88.2  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  36.54 
 
 
158 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  31.51 
 
 
158 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  32.39 
 
 
156 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  32.39 
 
 
156 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  32.39 
 
 
156 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 
165 aa  87.8  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>