258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2545 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  338  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  88.89 
 
 		 163 aa  303  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  87.65 
 
 		 163 aa  303  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  78.4 
 
 		 163 aa  272  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  79.5 
 
 		 163 aa  268  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  77.64 
 
 		 163 aa  268  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  76.54 
 
 		 163 aa  267  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  75.78 
 
 		 175 aa  266  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  76.4 
 
 		 163 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  76.4 
 
 		 163 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  76.4 
 
 		 163 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  76.4 
 
 		 163 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  76.4 
 
 		 163 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  76.4 
 
 		 163 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  76.4 
 
 		 163 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  78.26 
 
 		 163 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  75.16 
 
 		 163 aa  263  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  77.64 
 
 		 163 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  77.64 
 
 		 163 aa  262  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  77.02 
 
 		 163 aa  261  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  76.4 
 
 		 163 aa  259  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  73.91 
 
 		 163 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  74.21 
 
 		 166 aa  250  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  73.58 
 
 		 166 aa  249  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  74.53 
 
 		 166 aa  246  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  72.9 
 
 		 167 aa  240  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  70.25 
 
 		 164 aa  237  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  70.19 
 
 		 187 aa  229  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  66.88 
 
 		 163 aa  227  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  67.5 
 
 		 163 aa  224  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  66.88 
 
 		 163 aa  222  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  63.46 
 
 		 161 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  69.23 
 
 		 160 aa  214  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  65 
 
 		 160 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  69.23 
 
 		 160 aa  212  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0535  hypothetical protein  62.5 
 
 		 163 aa  209  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  64.9 
 
 		 160 aa  204  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1195  ybaK/ebsC protein  62.82 
 
 		 162 aa  204  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  63.58 
 
 		 162 aa  204  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  61.59 
 
 		 160 aa  194  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  62.25 
 
 		 160 aa  192  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  62.84 
 
 		 160 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  62.16 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  55.56 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.05 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  53.75 
 
 		 161 aa  173  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2007  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.38 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  48.2 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  43.24 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  39.13 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  40.54 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  42.03 
 
 		 157 aa  98.2  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  41.3 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  39.86 
 
 		 157 aa  97.4  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  41.06 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  38.1 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  38.78 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  39.46 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  37.68 
 
 		 157 aa  91.3  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  34.19 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  36.24 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  41.73 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  36.13 
 
 		 166 aa  87.8  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  34.57 
 
 		 163 aa  87.4  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  33.78 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  32.73 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  34.75 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  34.75 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  34.75 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  37.16 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  37.96 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  35.62 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  32.62 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  36.11 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  33.55 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  34.93 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  31.82 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  40.29 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  32.53 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  32.53 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  32.9 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  32.53 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  32.53 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  32.53 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  34.93 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  37.84 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  31.54 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  34.93 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  30.91 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  30.91 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  31.17 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  30.91 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  30.91 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1029  hypothetical protein  34.84 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  31.61 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  30.91 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>