More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3248 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 160 aa  321  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  98.12 
 
 		 160 aa  317  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  94.38 
 
 		 160 aa  308  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  77.99 
 
 		 160 aa  259  8e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  73.72 
 
 		 160 aa  236  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  73.72 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  66.88 
 
 		 160 aa  223  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  64.78 
 
 		 162 aa  222  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1195  ybaK/ebsC protein  69.28 
 
 		 162 aa  223  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  70.83 
 
 		 163 aa  213  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  71.33 
 
 		 163 aa  213  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  71.33 
 
 		 163 aa  213  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  65.79 
 
 		 167 aa  213  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  69.23 
 
 		 163 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  68.75 
 
 		 163 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  70.14 
 
 		 163 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  70.14 
 
 		 163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  70.14 
 
 		 163 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  68.53 
 
 		 166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  68.53 
 
 		 166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  62.18 
 
 		 160 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  67.36 
 
 		 163 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  68.53 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  68.53 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  68.53 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  68.53 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  68.53 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  68.53 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  68.53 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0535  hypothetical protein  61.29 
 
 		 163 aa  208  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  61.54 
 
 		 161 aa  209  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  67.36 
 
 		 163 aa  208  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.42 
 
 		 160 aa  207  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  64.71 
 
 		 166 aa  207  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  66.43 
 
 		 175 aa  204  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  67.83 
 
 		 163 aa  204  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  65.54 
 
 		 164 aa  203  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.11 
 
 		 163 aa  203  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  68.35 
 
 		 163 aa  203  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  60.51 
 
 		 161 aa  202  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  67.83 
 
 		 163 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  61.18 
 
 		 163 aa  197  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  65.03 
 
 		 161 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  65.73 
 
 		 163 aa  196  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  66.22 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  62.94 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2007  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.91 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  44.29 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  44.08 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  44.14 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  41.45 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  41.14 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  39.62 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  44.14 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  39.73 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  39.61 
 
 		 158 aa  97.1  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  40.91 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  38.73 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  40.82 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  41.38 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  37.34 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  37.34 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  35.62 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  39.61 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  31.41 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  31.41 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  31.17 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  34.84 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  35.57 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  30.52 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  37.91 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  29.87 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  30.52 
 
 		 158 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  30.52 
 
 		 158 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  37.75 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  35.06 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  30.97 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  31.37 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  30.32 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  28.57 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  28.57 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  33.99 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  31.41 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  31.47 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  26.32 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  31.61 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  28.57 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  38.96 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  30.32 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  31.41 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>