280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04560 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  100 
 
 		 157 aa  313  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  62.59 
 
 		 157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  61.87 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  57.05 
 
 		 157 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  59.71 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  57.05 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  56.67 
 
 		 157 aa  170  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  58.27 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  53.21 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  58.55 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  53.96 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  57.55 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  58.99 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  55.26 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  54.07 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  53.59 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.68 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1391  ybaK/ebsC protein  59.15 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  51.8 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  44.16 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  44.06 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  43.65 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  36.36 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  43.62 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  45.07 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  45.26 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1664  ybaK/ebsC protein  46.04 
 
 		 170 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773078  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  35.33 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  40.38 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  38.19 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  35.33 
 
 		 162 aa  100  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  38.16 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  36.84 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  41.26 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  44.08 
 
 		 163 aa  100  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  38.16 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6293  ybaK/ebsC protein  43.97 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  40.56 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  44.59 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  40.67 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  37.5 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  38.56 
 
 		 156 aa  97.8  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3500  ybaK/ebsC protein  37.01 
 
 		 155 aa  97.1  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00301765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  39.1 
 
 		 166 aa  97.1  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  38.82 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  39.1 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  37.86 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  38.56 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  36.94 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  36.42 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  38 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4191  ybaK/ebsC protein  43.23 
 
 		 186 aa  94.4  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0625449  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  37.66 
 
 		 169 aa  94.4  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  39.33 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  32.47 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  41.43 
 
 		 161 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  37.14 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  37.32 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  40.3 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  38.67 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  39.1 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  46.43 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  38.46 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  37.82 
 
 		 163 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  40 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  34.81 
 
 		 166 aa  90.9  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01257  hypothetical protein  38.89 
 
 		 157 aa  90.9  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  34.67 
 
 		 159 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  37.34 
 
 		 175 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  36.96 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  37.18 
 
 		 163 aa  90.5  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  39.1 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  37.75 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  35.33 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  35.33 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  35.33 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  35.33 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  35.33 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  35.33 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  35.33 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  35.33 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  38.82 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  34.23 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  38.3 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  37.76 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  34.97 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  36.31 
 
 		 163 aa  87.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  34.51 
 
 		 157 aa  87.4  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004197  transcriptional regulator  38.19 
 
 		 157 aa  87.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  36.54 
 
 		 163 aa  87.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  35.67 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  38.24 
 
 		 155 aa  87  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.41 
 
 		 163 aa  87  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  38.51 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  34.97 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  35.94 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  39.68 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  37.24 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  38.35 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>