296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2605 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  99.39 
 
 		 163 aa  331  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  96.32 
 
 		 163 aa  323  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  96.32 
 
 		 163 aa  322  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  95.71 
 
 		 163 aa  321  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  95.09 
 
 		 163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  90.18 
 
 		 163 aa  307  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  90.18 
 
 		 163 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  90.18 
 
 		 163 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  90.18 
 
 		 163 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  90.18 
 
 		 163 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  90.18 
 
 		 163 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  90.18 
 
 		 163 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  90.18 
 
 		 163 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  87.73 
 
 		 163 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  87.12 
 
 		 163 aa  298  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  84.66 
 
 		 175 aa  293  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  79.14 
 
 		 163 aa  271  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  77.3 
 
 		 163 aa  267  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  79.25 
 
 		 166 aa  264  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  76.07 
 
 		 163 aa  263  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  76.69 
 
 		 163 aa  263  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  78.62 
 
 		 166 aa  262  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  80.65 
 
 		 167 aa  262  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  77.02 
 
 		 163 aa  261  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  77.07 
 
 		 166 aa  254  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  75.62 
 
 		 163 aa  252  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  75.62 
 
 		 187 aa  248  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  75 
 
 		 163 aa  247  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  73.75 
 
 		 163 aa  245  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  74.05 
 
 		 164 aa  243  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  70.62 
 
 		 161 aa  239  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0535  hypothetical protein  65 
 
 		 163 aa  213  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1195  ybaK/ebsC protein  64.2 
 
 		 162 aa  213  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  66.88 
 
 		 160 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  65.62 
 
 		 160 aa  211  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  70.14 
 
 		 160 aa  211  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  66.89 
 
 		 160 aa  210  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  67.11 
 
 		 162 aa  210  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  67.13 
 
 		 160 aa  204  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  65.1 
 
 		 160 aa  204  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  61.18 
 
 		 161 aa  197  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  65.56 
 
 		 160 aa  197  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  59.38 
 
 		 161 aa  190  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  60.26 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  58.71 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2007  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.75 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  44.6 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  43.24 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  41.03 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  43.88 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  41.01 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  37.34 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  37.34 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  40.54 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  41.73 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  37.18 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  41.03 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  36.25 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  36.71 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  36.88 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  36.71 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  35 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  34.18 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  34.18 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  34.18 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  34.18 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  34.18 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  37.11 
 
 		 169 aa  91.3  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  38.85 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  39.1 
 
 		 157 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  35.37 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  35.26 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  33.75 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  37.18 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  38.41 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  37.58 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  35.42 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  35.21 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  35.21 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  35.21 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  35.21 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  34.51 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  30.61 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  37.24 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  32.03 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  33.78 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  32.88 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  34.75 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  32.19 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  32.19 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>