272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3088 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  80.12 
 
 		 161 aa  257  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  75 
 
 		 160 aa  255  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  75.62 
 
 		 160 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  74.38 
 
 		 160 aa  248  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  71.52 
 
 		 162 aa  245  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  68.75 
 
 		 160 aa  237  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  67.52 
 
 		 160 aa  226  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  67.92 
 
 		 161 aa  226  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  67.52 
 
 		 160 aa  224  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  66.88 
 
 		 160 aa  223  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  66.67 
 
 		 160 aa  214  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1195  ybaK/ebsC protein  65.58 
 
 		 162 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0535  hypothetical protein  61.78 
 
 		 163 aa  205  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  63.58 
 
 		 167 aa  204  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  63.06 
 
 		 187 aa  201  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  64.71 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  64.71 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  64.71 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  64.71 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  64.71 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  64.71 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  64.71 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  65.13 
 
 		 166 aa  199  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  64.05 
 
 		 163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  67.88 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  63.58 
 
 		 164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  64.47 
 
 		 166 aa  197  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  67.13 
 
 		 163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  67.83 
 
 		 163 aa  197  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  65.56 
 
 		 163 aa  197  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  65.56 
 
 		 163 aa  197  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  67.13 
 
 		 163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  67.13 
 
 		 163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  61.88 
 
 		 161 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  65.03 
 
 		 163 aa  193  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  62.25 
 
 		 163 aa  192  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  63.16 
 
 		 163 aa  191  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  61.39 
 
 		 163 aa  191  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  62.94 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  62.5 
 
 		 163 aa  188  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  60 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  59.12 
 
 		 163 aa  187  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  60.13 
 
 		 163 aa  187  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.18 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  60.93 
 
 		 175 aa  185  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2007  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.88 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  43.62 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  44.93 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  44.6 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  42.14 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  39.1 
 
 		 169 aa  94.4  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  38.62 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  41.43 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  39.04 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  37.16 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  38.82 
 
 		 157 aa  90.9  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  35.9 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  37.24 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  35.86 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  36.67 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  39.13 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  40.35 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  31.03 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  34.69 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  31.01 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  31.01 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  31.97 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  31.01 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  31.41 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  32.47 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  33.11 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  31.82 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  35.71 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  31.82 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  34.42 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  31.91 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  29.94 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  31.82 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  35.9 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  29.3 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  26.17 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  32.85 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  30.52 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  29.3 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0122906 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  29.3 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  29.3 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  29.3 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  29.3 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  29.3 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  29.3 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  29.94 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  32.48 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  27.63 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  32.47 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  27.4 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>