271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1401 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 160 aa  324  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  96.88 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  73.58 
 
 		 162 aa  249  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  74.38 
 
 		 160 aa  248  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  73.72 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  68.94 
 
 		 161 aa  233  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  68.75 
 
 		 160 aa  233  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  72.44 
 
 		 160 aa  231  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  71.79 
 
 		 160 aa  230  6e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  66.88 
 
 		 160 aa  228  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  68.59 
 
 		 160 aa  223  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  66.04 
 
 		 161 aa  220  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1195  ybaK/ebsC protein  67.53 
 
 		 162 aa  219  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  66.89 
 
 		 163 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  66.89 
 
 		 163 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  66.89 
 
 		 163 aa  205  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0535  hypothetical protein  60 
 
 		 163 aa  204  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  65.1 
 
 		 163 aa  204  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  65.1 
 
 		 163 aa  204  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  65.1 
 
 		 163 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  65.1 
 
 		 163 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  65.1 
 
 		 163 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  63.16 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  63.16 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  63.76 
 
 		 163 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  63.76 
 
 		 163 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  63.76 
 
 		 163 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  63.76 
 
 		 163 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  63.76 
 
 		 163 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  63.76 
 
 		 163 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  63.76 
 
 		 163 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  62.5 
 
 		 166 aa  200  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  62.42 
 
 		 163 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  62.25 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.84 
 
 		 163 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  62.42 
 
 		 175 aa  193  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  61.69 
 
 		 164 aa  193  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  65.47 
 
 		 163 aa  191  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  63.51 
 
 		 163 aa  189  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  64.19 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  62.84 
 
 		 163 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  58.75 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  60 
 
 		 187 aa  185  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  59.21 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  57.89 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  55.97 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2007  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.88 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  41.45 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  42.36 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  40.28 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  40.85 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  37.84 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  37.75 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  36.77 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  39.16 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  37.75 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  40.14 
 
 		 157 aa  90.9  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  39.44 
 
 		 157 aa  90.9  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  33.77 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  31.65 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  31.65 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  36.88 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  31.01 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  35.1 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 		 166 aa  87  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  30.26 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  30.82 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  29.61 
 
 		 162 aa  84  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  30.13 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  33.12 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  36.36 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  28.97 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  32.68 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  31.17 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  31.41 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  30.57 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  29.49 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  32.67 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  32.43 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  34.19 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.7 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  32.03 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  26.83 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  26.83 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  34.27 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  26.83 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  34.46 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  26.83 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  26.99 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  26.9 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  26.83 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  26.83 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  30.52 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  31.82 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  30.52 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  28.67 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  35.71 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  30.61 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  35.26 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  26.99 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>