More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0136 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  317  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  73.89 
 
 		 157 aa  237  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  74.52 
 
 		 157 aa  229  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  74.65 
 
 		 157 aa  227  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  69.43 
 
 		 157 aa  226  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  76.06 
 
 		 157 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  70.7 
 
 		 157 aa  220  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  71.97 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  66.24 
 
 		 157 aa  217  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  69.01 
 
 		 157 aa  209  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  64.74 
 
 		 157 aa  209  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  65.61 
 
 		 158 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  69.43 
 
 		 158 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  63.4 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  63.69 
 
 		 157 aa  190  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.24 
 
 		 165 aa  177  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1391  ybaK/ebsC protein  64.54 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  54.19 
 
 		 158 aa  163  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  53.96 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  51.8 
 
 		 170 aa  141  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  43.71 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  51.82 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  50.72 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  41.78 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  42.47 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  40.29 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  42.57 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6293  ybaK/ebsC protein  50.36 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  40.79 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1664  ybaK/ebsC protein  43.87 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773078  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  41.56 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  41.29 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  39.47 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  39.19 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  39.74 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  39.87 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  39.73 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  40.4 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  39.07 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  41.48 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  41.73 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  37.58 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  42.31 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  39.73 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  47.33 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01257  hypothetical protein  42.54 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  38.31 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  38.31 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  43.9 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  38.31 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  38.31 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  38.31 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  43.85 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  39.86 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  43.8 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  39.86 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  38.41 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  40.52 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  39.31 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004197  transcriptional regulator  42.54 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136904  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  40.94 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  39.13 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  44.63 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  44.63 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  39.46 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  40.26 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  44.63 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30720  ybaK/ebsC protein  43.14 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  37.41 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  38.06 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  44.72 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  43.08 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  38.41 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1750  hypothetical protein  41.79 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0053342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  43.08 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  36.94 
 
 		 172 aa  101  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  34.93 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  38.93 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4191  ybaK/ebsC protein  48.2 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0625449  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  40.27 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  37.66 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  37.84 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  41.22 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  42.98 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  38.22 
 
 		 163 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  38.93 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  37.68 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  38.41 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  37.5 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4688  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.12 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80799  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  40.54 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  39.49 
 
 		 163 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  38.17 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  38.17 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>