272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1602 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 162 aa  333  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  57.69 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  55.56 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  50.32 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  54.79 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  49.68 
 
 		 156 aa  157  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  52.78 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  49.68 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  46.2 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  48.99 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  44.52 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  43.66 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  43.56 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  42.86 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  38.96 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  38.31 
 
 		 161 aa  123  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  40.76 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  41.13 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  38.85 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  40.41 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  38.22 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  38.22 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  38.22 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  37.66 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  39.73 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  39.73 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  39.73 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  34.87 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  39.04 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  41.94 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  40.51 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  45.7 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  42.36 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  41.56 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  41.56 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  37.09 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  40.88 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  37.09 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  43.15 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  37.91 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  41.43 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  41.29 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  40.51 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  44.72 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.31 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  39.1 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  40.91 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  43.9 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  39.57 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  40.13 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  38.16 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  39.24 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  39.16 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0753  ebsC family protein, putative  36.94 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  38.85 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  40.26 
 
 		 156 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  38.36 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  39.61 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  40.54 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.1 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  39.61 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  32.91 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  40 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  39.61 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  40.37 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  37.01 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  40.43 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  40.69 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  39.49 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  36.94 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  44.26 
 
 		 155 aa  94.4  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  36.94 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  42.62 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  36.94 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  36.94 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  36.94 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  36.94 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4191  ybaK/ebsC protein  43.75 
 
 		 186 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0625449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  36.94 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  40.82 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  36.94 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  40.82 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  40.98 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  40.98 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  39.35 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  38.85 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  37.58 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  38.1 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  36.31 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  37.2 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  39.49 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  37.58 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  40.5 
 
 		 168 aa  90.9  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  39.22 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  40.98 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  41.8 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  40.98 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  37.86 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  41.8 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>