More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3668 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  71.97 
 
 		 157 aa  230  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  72.44 
 
 		 157 aa  229  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  74.13 
 
 		 157 aa  225  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  75.8 
 
 		 157 aa  223  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  70.06 
 
 		 157 aa  220  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  73.76 
 
 		 157 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  72.61 
 
 		 157 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  65.61 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  70.7 
 
 		 157 aa  210  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  68.15 
 
 		 157 aa  205  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  66.88 
 
 		 158 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  65.36 
 
 		 166 aa  199  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  68.79 
 
 		 157 aa  198  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1391  ybaK/ebsC protein  71.81 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  65.61 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.26 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  57.42 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  56.12 
 
 		 157 aa  156  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  51.97 
 
 		 170 aa  140  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  43.71 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  43.42 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  50.99 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  44.44 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  48.68 
 
 		 169 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  47.1 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  40.29 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  45.26 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  45.26 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  42.11 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  42.48 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4191  ybaK/ebsC protein  50.65 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0625449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3500  ybaK/ebsC protein  40.79 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00301765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6293  ybaK/ebsC protein  48.34 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  42.28 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  40.52 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  41.67 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  44.9 
 
 		 168 aa  110  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1664  ybaK/ebsC protein  45.86 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773078  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30720  ybaK/ebsC protein  46.41 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  43.71 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  36.94 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  41.45 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  38.85 
 
 		 155 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  42.11 
 
 		 156 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  39.04 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  35.71 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  36.94 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  37.67 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  37.66 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  43.17 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  35.06 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  43.17 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  37.01 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  38.85 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  39.29 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  37.91 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  42.45 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  37.86 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  39.61 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  42.45 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  42.38 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01257  hypothetical protein  36.77 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3346  ybaK/ebsC protein  45.26 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  33.77 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  34.51 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  34.51 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  42.34 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  40.91 
 
 		 169 aa  100  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  33.12 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1750  hypothetical protein  39.44 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0053342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  36.18 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004197  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  43.05 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  37.01 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  35.21 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  41.43 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  33.09 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1777  ybaK/ebsC protein  43.06 
 
 		 178 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875874 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0861  ybaK/ebsC protein  41.73 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.935106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2187  hypothetical protein  37.66 
 
 		 156 aa  97.8  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  41.67 
 
 		 172 aa  97.4  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  41.26 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1400  ybaK/ebsC protein  45.99 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0013  ybaK/ebsC protein  38.31 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  38.36 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  39.49 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  41.67 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>