295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3346 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3346  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 156 aa  306  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  87.1 
 
 		 156 aa  260  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  86.45 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  82.58 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  81.94 
 
 		 156 aa  253  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  82.05 
 
 		 156 aa  251  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  80.65 
 
 		 156 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  80.65 
 
 		 156 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  80.65 
 
 		 156 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  81.29 
 
 		 156 aa  246  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  79.35 
 
 		 155 aa  239  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  70.32 
 
 		 157 aa  203  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  62.75 
 
 		 154 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  58.6 
 
 		 159 aa  180  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  58.6 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  58.6 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  58.6 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  58.6 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  58.6 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  57.96 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  57.96 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  57.96 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  57.96 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  57.96 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  57.96 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  57.32 
 
 		 159 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  57.32 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  60.39 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  56.86 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  57.32 
 
 		 159 aa  173  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  55.41 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  56.05 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  64.05 
 
 		 155 aa  170  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  57.42 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  57.96 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  57.42 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  52.29 
 
 		 155 aa  166  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  57.42 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  57.42 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  57.42 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  56.69 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  54.97 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  58.06 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  56.77 
 
 		 170 aa  164  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  56.69 
 
 		 159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  56.69 
 
 		 159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  57.42 
 
 		 158 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  57.42 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  56.77 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  54.09 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  52.83 
 
 		 162 aa  160  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0092  ybaK/ebsC protein  59.6 
 
 		 156 aa  160  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  56.77 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  50.32 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  58.17 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  58.06 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0861  ybaK/ebsC protein  61.44 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.935106  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  54.9 
 
 		 156 aa  154  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3500  ybaK/ebsC protein  56.13 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00301765  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01257  hypothetical protein  58.06 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  56.13 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3029  hypothetical protein  57.32 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  53.85 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  55.19 
 
 		 166 aa  150  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2187  hypothetical protein  52.94 
 
 		 156 aa  150  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  54.84 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6293  ybaK/ebsC protein  59.87 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1029  hypothetical protein  55.41 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004197  transcriptional regulator  58.06 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136904  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0018  ybaK/ebsC protein  56 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  57.42 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  52.94 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  52.63 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  51.7 
 
 		 168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1750  hypothetical protein  55.41 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0053342  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1664  ybaK/ebsC protein  59.42 
 
 		 170 aa  143  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773078  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0013  ybaK/ebsC protein  55.56 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30720  ybaK/ebsC protein  57.24 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  53.9 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  50.98 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  50.34 
 
 		 162 aa  135  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  55.84 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  51.61 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  51.7 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  52.26 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4191  ybaK/ebsC protein  56.69 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0625449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  46.75 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1777  ybaK/ebsC protein  52.74 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875874 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  45.16 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1441  ybaK/ebsC protein  55.63 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1400  ybaK/ebsC protein  55.92 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4690  ybaK/ebsC protein  52.67 
 
 		 193 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121488  normal  0.0399012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  47.33 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  45.26 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  48.05 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  44.85 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1412  ybaK/ebsC protein  54.84 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1378  hypothetical protein  54.19 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1396  ybaK/ebsC protein  54.19 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  41.5 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>