273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0940 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 169 aa  349  1e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  53.42 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  50.97 
 
 		 161 aa  157  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  48.43 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  46.67 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  50.64 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  47.13 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  43.48 
 
 		 168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  43.56 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  43.56 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  44.1 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  44.1 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  44.1 
 
 		 158 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  45.34 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  43.48 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  44.03 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  44.1 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  44.1 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  46.67 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  43.48 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  43.48 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  43.67 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  44.94 
 
 		 164 aa  133  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  43.56 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  42.04 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  44.03 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  41.14 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  44.87 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  42.77 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  41.14 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  41.14 
 
 		 161 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  40.76 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.04 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  41.14 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  41.51 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  41.51 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  41.51 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  41.51 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  41.51 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  41.51 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  41.51 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  41.51 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  41.51 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  41.29 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  39.74 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  42.68 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  35.71 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  43.87 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  40.88 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  42.66 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  40.76 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  40.76 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  41.67 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  39.41 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  40.43 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  38.75 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  38.75 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  38.75 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  38.75 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  38.75 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  38.96 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  42.36 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  42.04 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  36.94 
 
 		 157 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  39.24 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  41.03 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  41.03 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  41.5 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  38.85 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  38.99 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  39.49 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  39.87 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  39.49 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  41.51 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  37.97 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  37.11 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  41.03 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  39.49 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  37.58 
 
 		 157 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  37.72 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  37.11 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  40.65 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  38.85 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  37.82 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  38.85 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  38.85 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  40.82 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  40.38 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  40.62 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  40.13 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  41.33 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  37.66 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  38.22 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  38.22 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  35.48 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  35.93 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  36.13 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  41.77 
 
 		 157 aa  97.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>