More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4777 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 158 aa  315  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  87.34 
 
 		 158 aa  268  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  73.89 
 
 		 157 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  78.34 
 
 		 157 aa  239  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  70.06 
 
 		 157 aa  231  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  70.7 
 
 		 157 aa  223  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  72.34 
 
 		 157 aa  220  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  67.33 
 
 		 157 aa  213  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  72.34 
 
 		 157 aa  213  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  71.63 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  63.33 
 
 		 157 aa  203  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  66.9 
 
 		 157 aa  200  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  62 
 
 		 157 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  68.21 
 
 		 157 aa  197  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  61.22 
 
 		 166 aa  179  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.96 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  57.69 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  57.55 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1391  ybaK/ebsC protein  60.4 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6293  ybaK/ebsC protein  51.97 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  45.7 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  46.75 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  44.22 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30720  ybaK/ebsC protein  49.35 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  43.24 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  42.48 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  44.44 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1664  ybaK/ebsC protein  45.03 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773078  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  46.71 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  39.75 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  40.52 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  48.92 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  43.06 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  40.82 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  42.48 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  46.43 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  46.38 
 
 		 159 aa  114  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  44.44 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  41.61 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  41.61 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  42.45 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  41.61 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  41.61 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  41.61 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  42.03 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  42.86 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  42.86 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  43.75 
 
 		 156 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  42.03 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  42.03 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  42.03 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  42.03 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  42.03 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  42.03 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  42.03 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  40.82 
 
 		 168 aa  110  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  40.29 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  40.27 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  42.03 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  42.45 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  44.2 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  40.37 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  42.68 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  38.96 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  41.94 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  43.06 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  41.94 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  42.03 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  43.06 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  42.68 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  41.3 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  41.98 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  40.26 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  42 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  40.91 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  41.03 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  42 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  42.36 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  42.04 
 
 		 163 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  41.77 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  40.26 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  41.4 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  39.33 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  41.14 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  42.65 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  42.65 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  42.04 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  41.14 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  41.4 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.61 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  39.46 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4191  ybaK/ebsC protein  47.14 
 
 		 186 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0625449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  43.48 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  41.18 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  39.47 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  43.48 
 
 		 159 aa  103  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  43.48 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  39.46 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  43.48 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>