More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1593 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  338  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  87.73 
 
 		 163 aa  301  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  84.05 
 
 		 163 aa  290  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  82.28 
 
 		 166 aa  273  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  82.91 
 
 		 166 aa  273  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  79.27 
 
 		 164 aa  270  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  79.25 
 
 		 161 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  78.88 
 
 		 167 aa  267  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  73.75 
 
 		 163 aa  245  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  73.75 
 
 		 163 aa  245  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  74.38 
 
 		 163 aa  243  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  73.12 
 
 		 163 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  72.5 
 
 		 163 aa  241  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  72.5 
 
 		 163 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  70 
 
 		 163 aa  236  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  70.62 
 
 		 163 aa  234  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  70.62 
 
 		 163 aa  234  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  70.62 
 
 		 163 aa  234  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  70.62 
 
 		 163 aa  234  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  70.62 
 
 		 163 aa  234  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  70.62 
 
 		 163 aa  234  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  70.62 
 
 		 163 aa  234  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  69.38 
 
 		 163 aa  234  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  70 
 
 		 163 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  68.12 
 
 		 175 aa  229  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.64 
 
 		 163 aa  228  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  71.43 
 
 		 166 aa  227  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  66.88 
 
 		 163 aa  222  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  65.03 
 
 		 163 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  65.62 
 
 		 187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  64.38 
 
 		 163 aa  214  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  64.38 
 
 		 163 aa  213  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0535  hypothetical protein  61.11 
 
 		 163 aa  199  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  60.39 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1195  ybaK/ebsC protein  60.65 
 
 		 162 aa  194  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  57.86 
 
 		 160 aa  194  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  61.84 
 
 		 160 aa  193  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  62.94 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  58.49 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  59.12 
 
 		 160 aa  187  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  55.9 
 
 		 162 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  55.28 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  55.97 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.83 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  57.33 
 
 		 160 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  53.16 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2007  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.82 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  48.92 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  47.3 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  46.43 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  46.43 
 
 		 157 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  42.86 
 
 		 158 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  43.05 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  43.17 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  41.73 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  40.71 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  38.93 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  36.31 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  38.93 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  32.03 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  39.55 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  40.54 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  40.14 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  34.53 
 
 		 157 aa  84  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  34.19 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  36.24 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  38.41 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  31.94 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  34.75 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  33.8 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  35.66 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  32.47 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  34.84 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  35.76 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  35.1 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  34.48 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  35.76 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  34.29 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1664  ybaK/ebsC protein  37.65 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773078  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  34.84 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  32.67 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  31.29 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  31.29 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  31.29 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  31.29 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  34.93 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  31.29 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  34.93 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  32.67 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  33.57 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  32.61 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  33.57 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  35.33 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  33.55 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  34.62 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  36.09 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  36.09 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>