269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0912 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 160 aa  329  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  75 
 
 		 160 aa  255  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  73.91 
 
 		 161 aa  246  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  69.18 
 
 		 162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  70.62 
 
 		 160 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  66.67 
 
 		 161 aa  229  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  66.88 
 
 		 160 aa  228  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  66.25 
 
 		 160 aa  228  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  63.46 
 
 		 160 aa  214  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  62.82 
 
 		 160 aa  211  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  62.18 
 
 		 160 aa  211  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  62.82 
 
 		 160 aa  210  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0535  hypothetical protein  59.24 
 
 		 163 aa  203  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1195  ybaK/ebsC protein  61.44 
 
 		 162 aa  201  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  62.5 
 
 		 167 aa  198  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  61.18 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  61.18 
 
 		 166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  60.49 
 
 		 164 aa  197  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  61.59 
 
 		 163 aa  194  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  63.01 
 
 		 166 aa  193  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.53 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  61.59 
 
 		 163 aa  191  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  58.49 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  58.13 
 
 		 161 aa  191  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  61.18 
 
 		 163 aa  191  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  60.26 
 
 		 163 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  60.26 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  60.26 
 
 		 163 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  60.26 
 
 		 163 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  60.26 
 
 		 163 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  58.13 
 
 		 163 aa  187  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  58.75 
 
 		 163 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  60.26 
 
 		 175 aa  187  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  57.5 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  57.5 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  58.28 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  60.26 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  57.5 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  58.28 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  57.5 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  57.5 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  57.5 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  57.5 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  56.33 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  56.95 
 
 		 163 aa  185  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  57.24 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2007  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.12 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  42.57 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  41.73 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  41.43 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  37.18 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  37.41 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  36 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  37.32 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  35.1 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  31.85 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  36.05 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  37.06 
 
 		 157 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  35.37 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  31.21 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  29.94 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  33.54 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  30.38 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  30.38 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  36.42 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  39.09 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  27.52 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  28.19 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  32.52 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  34.44 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  28.1 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  37.01 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  35.71 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1029  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  33.81 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  29.94 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  29.94 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  27.78 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  30.63 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  27.74 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  29.3 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  29.3 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  29.3 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  26.45 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  29.3 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  29.3 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  29.25 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  28.66 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  26.45 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  26.45 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  34.64 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  27.1 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  27.74 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  27.74 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3029  hypothetical protein  29.3 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  33.76 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  28.03 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  28.03 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  27.74 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  27.74 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>