More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2007 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2007  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 163 aa  329  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  47.47 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  45.91 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  45.86 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  42.14 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0535  hypothetical protein  39.88 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  41.88 
 
 		 175 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  43.75 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  43.75 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  43.12 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  43.75 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  42.5 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  43.75 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  43.75 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  43.75 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  43.75 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  43.75 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  43.75 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  43.75 
 
 		 163 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  45.83 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  41.25 
 
 		 163 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  43.75 
 
 		 163 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  43.75 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  43.75 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  41.25 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.62 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  42.11 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  43.12 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  42.38 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  43.67 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  42.76 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  41.88 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  42.04 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  41.45 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.99 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  41.45 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  40 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  43.62 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  41.88 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  41.88 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  41.83 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  40.79 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1195  ybaK/ebsC protein  40.52 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  40.79 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  42.68 
 
 		 187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  39.13 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  38.82 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  37.59 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  38.85 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  38.93 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  39.02 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  36.69 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  37.68 
 
 		 156 aa  84  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  31.58 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  41.07 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  39.34 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  35.25 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  39.53 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  38.02 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  35.44 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  40.91 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  38.79 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  40.74 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  34.81 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  38.02 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  34.53 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  40.37 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  34.39 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  37.98 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  38.28 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  38.28 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  40.28 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  34.87 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  39.09 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  32.03 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  39.84 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  31.45 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  37.4 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  37.93 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  32.05 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  31.62 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  39.17 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  32.05 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  31.45 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  32.05 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  31.76 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  32.52 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  28.1 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>