295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2645 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 160 aa  323  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  68.75 
 
 		 160 aa  237  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  68.12 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  68.75 
 
 		 160 aa  233  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  70.62 
 
 		 160 aa  232  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  68.32 
 
 		 161 aa  231  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  66.04 
 
 		 162 aa  228  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  64.78 
 
 		 161 aa  217  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  62.42 
 
 		 160 aa  207  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  61.78 
 
 		 160 aa  206  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  61.15 
 
 		 160 aa  202  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  61.78 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1195  ybaK/ebsC protein  59.24 
 
 		 162 aa  201  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0535  hypothetical protein  55.9 
 
 		 163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  60.78 
 
 		 163 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  60.78 
 
 		 163 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  60.78 
 
 		 163 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  60.78 
 
 		 163 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  60.78 
 
 		 163 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  60.78 
 
 		 163 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  60.78 
 
 		 163 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  60.78 
 
 		 163 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  58.33 
 
 		 167 aa  193  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  59.46 
 
 		 166 aa  191  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  61.49 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  61.49 
 
 		 163 aa  188  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  59.46 
 
 		 166 aa  188  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  61.49 
 
 		 163 aa  188  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  58.78 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  61.49 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  59.35 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  57.32 
 
 		 164 aa  187  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  58.71 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  59.48 
 
 		 163 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  59.48 
 
 		 163 aa  185  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  58.78 
 
 		 163 aa  184  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.78 
 
 		 163 aa  183  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  56.05 
 
 		 163 aa  183  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  55.48 
 
 		 187 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  57.05 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  57.52 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  59.6 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  57.43 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  55.77 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  52.83 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  54.14 
 
 		 163 aa  173  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2007  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.62 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  41.22 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  40.71 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  40 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  38.73 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  35.26 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  36.05 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  38.57 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  34.23 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  32.28 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  36.24 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  32.67 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  35.1 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  32.39 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  29.17 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  31.33 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  27.59 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  30.38 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  30.13 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  28.85 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  31.41 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  36.05 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  29.68 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  30.87 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  29.49 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  30.83 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  29.49 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  30.87 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  30.52 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  30.87 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  31.29 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  29.41 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  30.2 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  34.75 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  28.29 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  30.13 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  30.13 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  30.13 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.5 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  33.04 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  31.79 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  28.21 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  30.13 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  31.48 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  31.29 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  26.92 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  28.1 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  33.97 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  29.86 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>