245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1566 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 161 aa  322  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  89.44 
 
 		 161 aa  291  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  97.27 
 
 		 112 aa  215  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  60.25 
 
 		 161 aa  197  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  61.15 
 
 		 158 aa  191  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  61.15 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  60.51 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  61.15 
 
 		 158 aa  191  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  60.51 
 
 		 158 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  60.51 
 
 		 158 aa  190  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  60.51 
 
 		 158 aa  190  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  60.51 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  60.51 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  58.6 
 
 		 158 aa  186  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  56.58 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  55.84 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  45.91 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  48.05 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  46.36 
 
 		 157 aa  141  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  43.48 
 
 		 168 aa  140  9e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  44.16 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  42.14 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  42.96 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  42.38 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  43.12 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  43.12 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  41.14 
 
 		 169 aa  130  9e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  42.86 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  41.56 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.13 
 
 		 159 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  38.75 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  38.31 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  40.52 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  43.42 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  39.19 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  38.51 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  40.54 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  41.18 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  39.6 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  39.61 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  37.5 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  37.91 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  38.51 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  39.47 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  39.33 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  39.47 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  38.16 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  38.16 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  38.26 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  37.5 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  35.06 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  37.84 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  36.54 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  36.54 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  34.84 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  36.54 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  36.54 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  36.54 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  36.54 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  36.54 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  36.54 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  36.13 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  35.06 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  38.19 
 
 		 155 aa  94  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0753  ebsC family protein, putative  35.8 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  40.15 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  36.54 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  35.26 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  36.91 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3500  ybaK/ebsC protein  38.96 
 
 		 155 aa  92.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00301765  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01257  hypothetical protein  43.59 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  39.87 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0854  hypothetical protein  32.24 
 
 		 170 aa  90.9  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000580569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  34.19 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  35.9 
 
 		 159 aa  90.9  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  34.19 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  37.82 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  34.81 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0018  ybaK/ebsC protein  40.79 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  35.53 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  39.68 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  34.87 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004197  transcriptional regulator  42.95 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  39.01 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  32.05 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  41.13 
 
 		 155 aa  87  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  31.51 
 
 		 172 aa  87  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1750  hypothetical protein  41.67 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0053342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  37.5 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  36.42 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  35.9 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>