222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1956 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 164 aa  337  4e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  47.1 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  45.91 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  46.5 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  46.45 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  46.45 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  46.45 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  45.91 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  46.45 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  46.45 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  46.45 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  46.45 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  46.45 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  45.45 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  46.2 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  46.05 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  44.94 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  45.03 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  42.57 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.31 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  42 
 
 		 160 aa  123  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  42 
 
 		 160 aa  123  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  42.86 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  40.13 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  42.57 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  40.52 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  40.52 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  40.62 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  37.58 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  38.56 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  45.45 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  39.22 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  37.5 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  39.1 
 
 		 162 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  39.72 
 
 		 169 aa  100  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  44.35 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  36.77 
 
 		 159 aa  98.6  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.69 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  36.77 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  36.77 
 
 		 159 aa  97.8  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  37.25 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0854  hypothetical protein  34.9 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000580569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  45.16 
 
 		 154 aa  95.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  37.01 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  37.42 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  35.29 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  33.76 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  35.03 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  35.03 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  36 
 
 		 155 aa  88.6  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  35.03 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  35.03 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  35.03 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  35.03 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  33.99 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  42.98 
 
 		 155 aa  88.2  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  35.03 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  35.03 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  37.67 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  32.1 
 
 		 172 aa  87.8  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  34.84 
 
 		 163 aa  87  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  36.13 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  38.73 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  34.39 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  35.26 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  36.18 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  34.64 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2187  hypothetical protein  36.18 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3029  hypothetical protein  36.13 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  35.77 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  32.47 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  32.47 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  31.58 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  32.47 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0013  ybaK/ebsC protein  37.78 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  36.02 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1963  hypothetical protein  34.71 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0670259  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  32.47 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1441  ybaK/ebsC protein  37.41 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1029  hypothetical protein  34.84 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  31.82 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  31.82 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  31.17 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  33.55 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  36.13 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  34.44 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  37.88 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  34.57 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  31.82 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  31.82 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0753  ebsC family protein, putative  31.9 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>