235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0854 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0854  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  347  5e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000580569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  54.25 
 
 		 168 aa  173  8e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0358  transcriptional regulator  50.61 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1963  hypothetical protein  48.45 
 
 		 161 aa  157  9e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0670259  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1813  transcriptional regulator  45.78 
 
 		 169 aa  154  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0753  ebsC family protein, putative  46.2 
 
 		 157 aa  149  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  37.5 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  34.55 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  35.85 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  35.4 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  34.44 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  41.28 
 
 		 161 aa  94  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  33.95 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  34.84 
 
 		 158 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  33.74 
 
 		 161 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  34.62 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  31.41 
 
 		 157 aa  92  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  33.76 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  32.48 
 
 		 158 aa  91.7  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  34.19 
 
 		 158 aa  91.3  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  34.19 
 
 		 158 aa  91.3  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  42.86 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  33.55 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  33.55 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  32.9 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  32.9 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  33.55 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  32.9 
 
 		 158 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.4 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  34.87 
 
 		 168 aa  85.1  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  36.91 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  36.91 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  35.17 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  30.72 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  38.33 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  31.85 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  37.96 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.53 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  32.91 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  27.56 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  35.48 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  35.96 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  32.45 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  37.93 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  40.54 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  36.84 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  41.07 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  37.07 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  37.5 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  38.6 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  36.84 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  38.6 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  38.6 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  38.6 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  38.6 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  38.6 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  38.6 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  38.6 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  28.95 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  28.95 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  36.84 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  35.65 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  32.9 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  32.9 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  32.9 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  32.9 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  32.9 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  29.41 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  38.6 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  28.95 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  29.61 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  34.48 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0018  ybaK/ebsC protein  33.78 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021851 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  38.26 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  35.71 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  35.71 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  29.01 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  32.26 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  32.14 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  35.96 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  35.96 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  34.48 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  32.14 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1441  ybaK/ebsC protein  33.93 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  29.86 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  37.04 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  33.93 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  33.93 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  33.93 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  34.21 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  29.86 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  29.63 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  37.5 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  36.36 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>