234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0740 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  317  3.9999999999999996e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0753  ebsC family protein, putative  77.07 
 
 		 157 aa  252  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0358  transcriptional regulator  71.52 
 
 		 158 aa  232  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1813  transcriptional regulator  52.41 
 
 		 169 aa  171  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1963  hypothetical protein  52.2 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0670259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0854  hypothetical protein  49.68 
 
 		 170 aa  157  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000580569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  50.32 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  36.25 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  40.26 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  35.19 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  37.01 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  38.31 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  38.31 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  38.31 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  37.66 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  37.01 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  38.31 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  34.57 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  38.31 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  37.66 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  36.14 
 
 		 169 aa  94  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  34.42 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  40.35 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  31.85 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  34.67 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  34.84 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  33.54 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  32.3 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  31.61 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  32.5 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  32.5 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  32.91 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  32.89 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  40 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.82 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  35.14 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  34 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  38.79 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  38.79 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  38.79 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  38.79 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  38.79 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  38.79 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  38.79 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  38.79 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  33.99 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  33.99 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  34.38 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  30.86 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  35.21 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  38.79 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  33.99 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  30.82 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  38.26 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2187  hypothetical protein  36.67 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  34.9 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.66 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  33.99 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  36.21 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  37.93 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  37.93 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  37.93 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  37.93 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  37.93 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  30.52 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  37.07 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  36.11 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  34.33 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  28.21 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3500  ybaK/ebsC protein  35.1 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00301765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  37.39 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  37.39 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  35.34 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  36.21 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  31.54 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  33.82 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  35.34 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  36 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  30.2 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  33.82 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  30.2 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  35.96 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  33.04 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  33.58 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  32.9 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  31.85 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  35.4 
 
 		 112 aa  67  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  34.42 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  31.85 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  31.85 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0092  ybaK/ebsC protein  37.72 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  32.85 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0013  ybaK/ebsC protein  34.9 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>