270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2562 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  56.29 
 
 
161 aa  175  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  46.75 
 
 
161 aa  154  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  46.41 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  47.37 
 
 
158 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  50.35 
 
 
160 aa  147  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  50.35 
 
 
160 aa  147  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  47.59 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  47.13 
 
 
169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  47.37 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  48.32 
 
 
158 aa  144  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  46.71 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  47.37 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  48.7 
 
 
158 aa  144  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  46.05 
 
 
158 aa  144  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  48.75 
 
 
169 aa  143  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  46.05 
 
 
158 aa  143  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  46.05 
 
 
158 aa  143  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  46.05 
 
 
158 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  46.05 
 
 
158 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  50.37 
 
 
156 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  46.05 
 
 
158 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  47.02 
 
 
161 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  46.36 
 
 
161 aa  141  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  42.86 
 
 
168 aa  140  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  44.74 
 
 
158 aa  140  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  44.74 
 
 
158 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  44.74 
 
 
161 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  46.62 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  40.79 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  43.66 
 
 
162 aa  133  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  45.1 
 
 
161 aa  130  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  43.42 
 
 
160 aa  130  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  42.86 
 
 
164 aa  122  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  40.79 
 
 
158 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.3 
 
 
158 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  53.92 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  38.46 
 
 
156 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  36.42 
 
 
155 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  36.18 
 
 
160 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  38 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  36.6 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  36.6 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  37.82 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  35.26 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  35.26 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  37.25 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  36.91 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  36.13 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  36.6 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  39.47 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  37.18 
 
 
165 aa  95.5  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.87 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  36.6 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0753  ebsC family protein, putative  34.9 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  34.62 
 
 
158 aa  94  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  34.64 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  40.35 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  36.54 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  36.54 
 
 
159 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  36.54 
 
 
159 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  36.54 
 
 
159 aa  92  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  36.54 
 
 
159 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  34.84 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  34.84 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  34.84 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  34.16 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  36.54 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  36.54 
 
 
159 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  34.84 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  34.84 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  36.54 
 
 
159 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  34.84 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  34.19 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  34.19 
 
 
155 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1813  transcriptional regulator  33.33 
 
 
169 aa  92  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  33.99 
 
 
155 aa  91.7  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  34.62 
 
 
158 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  34.62 
 
 
158 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  33.76 
 
 
166 aa  91.3  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  38.1 
 
 
166 aa  91.3  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  34.64 
 
 
168 aa  91.3  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  36.54 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  34.62 
 
 
158 aa  90.9  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  41.33 
 
 
164 aa  90.9  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  33.75 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  32.69 
 
 
172 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0854  hypothetical protein  42.86 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000580569  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  34.62 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.53 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  33.97 
 
 
158 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  38.58 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  33.97 
 
 
158 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  30.32 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>