More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1005 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 158 aa  320  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  36.54 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  41.18 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  38.3 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  38.06 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  42.95 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  38.56 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  32.26 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  37.31 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  44.08 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  37.66 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  40.13 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  41.84 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  37.78 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  36.69 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  44.14 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  42.75 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  43.31 
 
 		 157 aa  97.1  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  36.07 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  32.69 
 
 		 160 aa  97.1  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  41.84 
 
 		 158 aa  97.1  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  43.9 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  40 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  44.92 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  41.18 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  42.11 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  38.06 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  41.13 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  28.39 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  39.72 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  39.72 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  33.97 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  39.72 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  40.43 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  39.69 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  43.9 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  43.33 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  39.72 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1441  ybaK/ebsC protein  43.2 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  38.58 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  43.09 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  38.99 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  31.37 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  37.74 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  37.74 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  26.8 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  37.74 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  37.74 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  39.72 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  37.74 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  37.82 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  37.74 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  40.52 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  40.52 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  37.74 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  40.52 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  27.45 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  39.73 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  32.69 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  40.52 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  27.45 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  27.45 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  28.1 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  40.52 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  38.36 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  42.03 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  42.54 
 
 		 159 aa  90.9  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  40.13 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  26.8 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  26.8 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  43.8 
 
 		 160 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  37.11 
 
 		 159 aa  90.5  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  40.88 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  26.8 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  30.92 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  30.92 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  45.3 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  26.8 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  34.04 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  37.4 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  40.3 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  40.3 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  45.95 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  34.19 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  37.5 
 
 		 169 aa  87.4  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  37.25 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  41.04 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  41.04 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  41.04 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  32.68 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  41.04 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  41.04 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  39.47 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  40.65 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0854  hypothetical protein  35.4 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000580569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  38.03 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  38.58 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  35.92 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>