69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1668 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2074  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  84.85 
 
 
175 aa  290  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328816 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01744  hypothetical protein  83.64 
 
 
167 aa  289  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1404  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  83.64 
 
 
167 aa  289  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.812752  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1845  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  83.64 
 
 
167 aa  289  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.900726  normal  0.129019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01756  hypothetical protein  83.64 
 
 
167 aa  289  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1873  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  83.64 
 
 
167 aa  289  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1855  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  83.64 
 
 
167 aa  288  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2511  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  83.64 
 
 
167 aa  288  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.579279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1408  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  84.24 
 
 
175 aa  288  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.247573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1374  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  84.24 
 
 
175 aa  288  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.734452  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2041  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  83.03 
 
 
167 aa  287  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1894  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  83.64 
 
 
175 aa  285  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1391  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  84.24 
 
 
175 aa  286  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000245761 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2011  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  81.82 
 
 
167 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.111031  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1112  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.03 
 
 
191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5754  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.67 
 
 
163 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.036925  hitchhiker  0.00000000000572699 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1821  YbaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  44.56 
 
 
191 aa  159  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5859  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.72 
 
 
173 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284913  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3920  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.72 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4448  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.72 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1495  hypothetical protein  46.75 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301949  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3880  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.31 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.745877  normal  0.0848334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4341  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.81 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-like protein  39.19 
 
 
162 aa  104  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.702018  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  25.17 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  25.17 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  25.17 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.85 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2070  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.78 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0237486  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  25.17 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  24.49 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  24.49 
 
 
159 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0933  hypothetical cytosolic protein  23.68 
 
 
151 aa  51.2  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2082  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.92 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1929  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.81 
 
 
170 aa  50.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.81 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  24.49 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2116  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.74 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0022261  decreased coverage  0.00203199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3691  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.53 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1791  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.95 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  23.81 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0125  hypothetical protein  23.81 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00974203  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1758  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.62 
 
 
154 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  22.82 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2156  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.92 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.284719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4653  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  26.39 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  29.85 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2486  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.29 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1756  hypothetical protein  26.85 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  25.69 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  29.41 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.97 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1215  hypothetical protein  24.18 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  35.48 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4026  hypothetical protein  29.23 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002475  putative DNA-binding protein  26.23 
 
 
160 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.61 
 
 
154 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0303  hypothetical protein  26 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000014956  unclonable  0.000000628456 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  21.54 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  31.68 
 
 
157 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0525  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.65 
 
 
152 aa  40.8  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00173992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  26.8 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  28.77 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  32.43 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.69 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3621  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.68 
 
 
199 aa  40.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1209  hypothetical protein  23.53 
 
 
151 aa  40.4  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 
157 aa  40.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>