294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002487 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  91.22 
 
 
157 aa  280  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.06 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375974  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.433754  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.07 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  29.25 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4341  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.45 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5579  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.06 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3880  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.79 
 
 
176 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.745877  normal  0.0848334 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  28.38 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1495  hypothetical protein  33.1 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301949  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5859  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.79 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284913  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3691  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.89 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4448  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.13 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  27.89 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3920  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.13 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00130  hypothetical protein  31.53 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  29.8 
 
 
159 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.76 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  30.07 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  29.14 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  22.96 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1027  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.14 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278653  normal  0.0205015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-like protein  27.97 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.702018  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  27.81 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.91 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  29.41 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01130  hypothetical protein  29.06 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  28.48 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  27.15 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  28.67 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0664  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.03 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0491998  hitchhiker  0.00288999 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  24.16 
 
 
166 aa  63.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4290  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000309077  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  30.33 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  29.37 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  28.38 
 
 
166 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  26.49 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  26.49 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  31.13 
 
 
155 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.74 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0596  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.16 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  28.67 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  28.77 
 
 
162 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5754  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.46 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.036925  hitchhiker  0.00000000000572699 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  28.67 
 
 
158 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  28.67 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3961  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.81 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.32 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2912  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.03 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14862  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  30.89 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  29.03 
 
 
170 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  28.07 
 
 
160 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4802  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  27.03 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.576416  normal  0.802544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  26.14 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  27.43 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4963  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  26.35 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289705  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  29.51 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4870  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  26.35 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00831587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.46 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4957  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  26.35 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4905  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  26.35 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286575  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1212  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.78 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0760914  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6129  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.21 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.684201  normal  0.245919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  25.49 
 
 
159 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  29.6 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0986  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.57 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.015482  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  27.05 
 
 
169 aa  57.4  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.35 
 
 
251 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  29.84 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1777  ybaK/ebsC protein  28.57 
 
 
178 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.875874 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  27.64 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32 
 
 
250 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6541  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.23 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.361078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1653  putative ybaK-like protein  25.85 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0968  hypothetical protein  28.37 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.107423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  31.08 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  27.87 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3353  hypothetical protein  34.85 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  22.97 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2074  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  26.03 
 
 
175 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328816 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  30.36 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  26.49 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  32 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  30.19 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  26.53 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  29.08 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>