297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2641 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 161 aa  307  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375974  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00130  hypothetical protein  63.82 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01130  hypothetical protein  63.27 
 
 		 153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.86 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1027  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.22 
 
 		 167 aa  157  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278653  normal  0.0205015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.84 
 
 		 172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.433754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.9 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.3 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.75 
 
 		 171 aa  127  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5579  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.97 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  33.08 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  32.06 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.25 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  35 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  33.88 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  36.07 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  31.61 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  34.15 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  32.56 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  32.03 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  32.03 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  35.9 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  33.03 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  32.8 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  35.2 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  31.25 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  27.2 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  32.03 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  30.77 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  37.58 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  29.23 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  31.25 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  31.25 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  30.23 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  34.4 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  34.4 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  34.4 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  34.4 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  34.4 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  34.4 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  32.21 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  34.4 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  37.74 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  33.87 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  35.66 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.93 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  32.2 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  33.06 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  28.32 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  28.32 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.31 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  33.07 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1029  hypothetical protein  33.07 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  31.36 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  31.16 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  28.23 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  33.07 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  31.62 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  31.2 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  31.2 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  31.2 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  31.62 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  31.2 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  31.2 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  33.81 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.81 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  37.04 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  26.23 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  29.27 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  23.68 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  29.13 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  31.71 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3029  hypothetical protein  31.5 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  33.6 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  29.75 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  29.91 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6293  ybaK/ebsC protein  37.9 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  32.65 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  28.93 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  29.91 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  29.66 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  30.51 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  28.35 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  27.64 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  31.5 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  28.35 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  31.97 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 566 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1653  putative ybaK-like protein  34.65 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  29.33 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.15 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  28.81 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  29.06 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 564 aa  54.3  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  29.17 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  26.25 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>