279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2700 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 165 aa  330  8e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  87.33 
 
 		 171 aa  247  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.58 
 
 		 154 aa  192  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5579  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.9 
 
 		 159 aa  191  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00130  hypothetical protein  57.24 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01130  hypothetical protein  54 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.15 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.9 
 
 		 161 aa  140  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375974  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.91 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.433754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1027  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.43 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278653  normal  0.0205015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.4 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  31.36 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  32.2 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  30.51 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  32.48 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  28.81 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  32.48 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  32.54 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  31.75 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  32.54 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  32.54 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  32.54 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  31.2 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  34.78 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  33.33 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  31.2 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  32.48 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  32.48 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.2 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  31.62 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 564 aa  58.5  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  27.12 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  30.51 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  28.67 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  28.23 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  28.81 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  30.65 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  32.8 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  28.21 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  28.7 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 576 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 573 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 569 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  28.21 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 570 aa  55.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  28.21 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 570 aa  54.7  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  29.91 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 		 574 aa  54.3  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 575 aa  54.3  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4802  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  30.23 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.576416  normal  0.802544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  27.54 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4963  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  30.23 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4870  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  30.23 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4957  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  30.23 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  31.71 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4905  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  30.23 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  31.03 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 574 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0350  prolyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 569 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.918323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  33.08 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  31.96 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 573 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  25.64 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 570 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 571 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  28.1 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5754  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.61 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.036925  hitchhiker  0.00000000000572699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  34.88 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  24.58 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.07 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  25.6 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  27.03 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  34.68 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  34.12 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.53 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  27.12 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  24 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  30.39 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  30.39 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  30.39 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  30.39 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  30.39 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  30.39 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  30.39 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  29.55 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 564 aa  51.6  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  26.67 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2267  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.71 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 		 577 aa  51.2  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 		 567 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 569 aa  51.2  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  24.8 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  25.6 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>