288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0121 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
172 aa  327  7e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.433754  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00130  hypothetical protein  62.75 
 
 
159 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01130  hypothetical protein  65.33 
 
 
153 aa  178  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1027  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  71.63 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278653  normal  0.0205015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  64.79 
 
 
174 aa  167  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  64.03 
 
 
161 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375974  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.91 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5579  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.78 
 
 
159 aa  143  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.35 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.12 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  37.91 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  40.98 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  29.6 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  29.6 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  35.06 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  32.41 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  30.33 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  31.01 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  36.6 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  32.64 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  29.6 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  29.33 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.13 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  29.6 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  34.01 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  32.54 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  37.25 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.88 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  35.57 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  34.43 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  33.6 
 
 
154 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  34.71 
 
 
163 aa  62  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.84 
 
 
154 aa  62  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  38.21 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  32.85 
 
 
157 aa  61.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  27.2 
 
 
158 aa  60.8  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  25.81 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  32.45 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  27.2 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  31.91 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  29.11 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  31.82 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  30.34 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  27.69 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  27.2 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  27.2 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  38.1 
 
 
157 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  30.95 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  31.43 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  26.27 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3691  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.57 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  31.3 
 
 
157 aa  59.3  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 
170 aa  58.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.4 
 
 
160 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  30.82 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  31.91 
 
 
157 aa  58.2  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  34.78 
 
 
160 aa  58.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  30.5 
 
 
166 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  30.07 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  26.71 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  31.2 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  33.85 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  31.08 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  31.75 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  33.81 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  33.59 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  33.08 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  33.59 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1391  ybaK/ebsC protein  36.21 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  23.03 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.94 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  31.53 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  31.71 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  30.36 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  33.08 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  27.61 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  32.31 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  31.2 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  31.2 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  31.2 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  31.2 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  31.2 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0933  hypothetical cytosolic protein  23.97 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  30.16 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  31.2 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  29.06 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  33.96 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  31.2 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  33.58 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.13 
 
 
161 aa  55.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  32.23 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  30.41 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  34.07 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  32.89 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  32.23 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>