236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0967 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
161 aa  323  8.000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  41.67 
 
 
157 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  39.22 
 
 
156 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  43.14 
 
 
158 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  40.51 
 
 
157 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  41.1 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  38.06 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  37.18 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  39.86 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  37.58 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  36.71 
 
 
157 aa  94.4  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  35.26 
 
 
157 aa  94  7e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  40.91 
 
 
157 aa  94  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  42.18 
 
 
156 aa  92.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  38.56 
 
 
166 aa  92  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  42.18 
 
 
154 aa  91.3  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  39.72 
 
 
157 aa  90.5  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  43.66 
 
 
160 aa  90.5  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  40.97 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  44.08 
 
 
172 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  36.36 
 
 
161 aa  89  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  35.22 
 
 
157 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  41.67 
 
 
160 aa  89  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  35.95 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  35.95 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  35.95 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  35.95 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  35.95 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  35.53 
 
 
157 aa  88.2  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  39.19 
 
 
165 aa  87.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  37.24 
 
 
157 aa  87.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  32.7 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  37.09 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  34.81 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  39.86 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  36.36 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  41.61 
 
 
170 aa  85.5  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  35.22 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  40.14 
 
 
168 aa  85.1  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  33.12 
 
 
158 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  39.74 
 
 
156 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  44.22 
 
 
163 aa  84.3  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.77 
 
 
158 aa  84  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  40.29 
 
 
164 aa  84  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  35.8 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  36.49 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  44.6 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  37.75 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  39.1 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  41.55 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  37.75 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  36 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  37.25 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  35.14 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  34.62 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  40.44 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  32.47 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  33.55 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  37.75 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  32.47 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  33.97 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4191  ybaK/ebsC protein  41.72 
 
 
186 aa  80.5  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0625449  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  34.64 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  36.6 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  34.64 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  34.64 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1391  ybaK/ebsC protein  38.82 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  34.64 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  34.64 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  34.64 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  34.64 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  37.76 
 
 
159 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  36.09 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  35.92 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  33.12 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  34.93 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  31.82 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  33.77 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  33.77 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  34.64 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  32.47 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  35.71 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  31.82 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  39.26 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  34.42 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  34.18 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  36 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  36 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  34.42 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  34.42 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  43.45 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  32.88 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  35.34 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  31.82 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  31.82 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  38.52 
 
 
156 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  35.17 
 
 
162 aa  77  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>