263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2987 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 171 aa  340  5.999999999999999e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  85.99 
 
 		 165 aa  274  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5579  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.54 
 
 		 159 aa  187  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.25 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00130  hypothetical protein  59.31 
 
 		 159 aa  170  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01130  hypothetical protein  53.69 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.29 
 
 		 174 aa  137  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.32 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375974  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.56 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.433754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1027  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.24 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278653  normal  0.0205015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.8 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  32.2 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  31.15 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  29.75 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  30.51 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  32.54 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  31.36 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  32.54 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.91 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  30.16 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  32.54 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  32.54 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  32.48 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  32.54 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  32.54 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  32.48 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  32.48 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  32 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 564 aa  58.9  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4802  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  30.23 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.576416  normal  0.802544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  28.57 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  27.05 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  38.46 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  30.43 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.44 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4963  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  29.46 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4905  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  29.46 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4957  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  29.46 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4870  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  29.46 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00831587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  31.71 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  36.29 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  29.91 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  32.31 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 576 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  26.61 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  29.66 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  29.37 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  34.96 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  27.27 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  29.1 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  31.45 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  26.23 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 573 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  27.05 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  27.64 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  29.06 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 573 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  30.08 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  27.78 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.1 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  28.07 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  29.27 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  23.39 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  28.95 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  28.95 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 570 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.24 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0451372  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  28.95 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  28.95 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  28.95 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  28.95 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  28.95 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 575 aa  52  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  28.1 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  31.93 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  32.54 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 569 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  27.35 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  27.87 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  28.69 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  33.61 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 582 aa  50.8  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1509  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.29 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.710297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 585 aa  50.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  26.5 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1212  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.44 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0760914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 571 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  30.32 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  29.17 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  32.11 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>