152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1509 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1509  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 162 aa  321  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.710297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1523  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  73.62 
 
 		 163 aa  239  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5963  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.05 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1918  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.13 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0942433  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0899  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.33 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3755  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.85 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3036  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.85 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.784305  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1128  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.84 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  30.56 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3353  hypothetical protein  34.33 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  32.03 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4709  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.75 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.15 
 
 		 250 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5754  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.56 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.036925  hitchhiker  0.00000000000572699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.76 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2103  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.45 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2267  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.92 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3288  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.58 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.29 
 
 		 171 aa  50.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0327  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.56 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0164  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.97 
 
 		 177 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0466  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.17 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.11 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1948  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.91 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  24.83 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.37 
 
 		 251 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  28.93 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  26.21 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  26.21 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.39 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0260  hypothetical protein  29.69 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0664  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.53 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0491998  hitchhiker  0.00288999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  28.67 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  28.93 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0706  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.07 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.69 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  28.93 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.07 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  24.11 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  25.35 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  26.67 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0439  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.33 
 
 		 173 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0596  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.78 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 574 aa  47.4  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0113  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.91 
 
 		 166 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2174  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.46 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000343666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0515  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.9 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0151737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.26 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1441  ybaK/ebsC protein  32.28 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  28.1 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  28.1 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  28.1 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3486  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.27 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2512  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.17 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  28.1 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  28.1 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  28.1 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  28.1 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  28.1 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 564 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  28.57 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  27.86 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 		 567 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.56 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  27.03 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  31.2 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  26.45 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.2 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  27.86 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5549  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.89 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  27.73 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1849  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.17 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.47 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.63 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.55 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 566 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3671  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.65 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4036  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.21 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.25 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.12 
 
 		 182 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0132  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4731  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.45 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0119  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.67 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0263477  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  27.35 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  29.5 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  26 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1347  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.26 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.949799  hitchhiker  0.00364047 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1813  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  27.21 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  25.37 
 
 		 157 aa  44.3  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  25 
 
 		 160 aa  43.9  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  29.14 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0203  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.78 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 567 aa  43.9  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.24 
 
 		 159 aa  43.9  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  28.08 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.45 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.433754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  24.11 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  26.02 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  22.96 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>