48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3742 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 169 aa  337  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  98.22 
 
 		 169 aa  333  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  94.67 
 
 		 169 aa  323  9e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  79.29 
 
 		 170 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.48 
 
 		 175 aa  215  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0317  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.3 
 
 		 169 aa  150  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0187831  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1835  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.59 
 
 		 167 aa  131  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0751413  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3283  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.01 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.76 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0894  hypothetical protein  40.72 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0838  hypothetical protein  40.72 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4608  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.37 
 
 		 172 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3776  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.49 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0933459  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4100  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.85 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.51 
 
 		 182 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  43.02 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4247  hypothetical protein  37.58 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2601  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  41.57 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2937  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  38.31 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.62 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40700  hypothetical protein  38.57 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.03 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1314  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.04 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683617  hitchhiker  0.00106774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3451  hypothetical protein  37.86 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4591  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.19 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.190429 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.03 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2315  hypothetical protein  27.92 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.35 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0857  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.53 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0125  hypothetical protein  25.68 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00974203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002475  putative DNA-binding protein  31.63 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  25 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  24.32 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.32 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  24.32 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1509  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.47 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.710297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  27.1 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1523  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.65 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  29.89 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  26.14 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  27.1 
 
 		 160 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  26.14 
 
 		 160 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.84 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>