41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2482 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
170 aa  339  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  81.07 
 
 
169 aa  278  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  80.47 
 
 
169 aa  274  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  79.29 
 
 
169 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.64 
 
 
175 aa  208  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0317  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.66 
 
 
169 aa  151  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0187831  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.04 
 
 
169 aa  131  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3283  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.64 
 
 
173 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0894  hypothetical protein  40 
 
 
180 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0838  hypothetical protein  40 
 
 
180 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3776  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.13 
 
 
169 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0933459  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1835  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.21 
 
 
167 aa  117  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0751413  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4100  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.85 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4608  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.25 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4247  hypothetical protein  37.82 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.89 
 
 
182 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  41.4 
 
 
171 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2601  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  42.68 
 
 
176 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2937  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  37.75 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.06 
 
 
158 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4591  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.01 
 
 
168 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.190429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1314  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.04 
 
 
182 aa  84.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683617  hitchhiker  0.00106774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40700  hypothetical protein  37.23 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.21 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3451  hypothetical protein  36.5 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.53 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0857  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.71 
 
 
154 aa  62  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2315  hypothetical protein  27.89 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  26.35 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  25.68 
 
 
159 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.32 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  25.68 
 
 
159 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  25.68 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0125  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00974203  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  25 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.31 
 
 
159 aa  47.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002475  putative DNA-binding protein  26.53 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.9 
 
 
174 aa  41.2  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>