42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3776 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3776  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0933459  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4100  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  91.12 
 
 		 169 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  75.15 
 
 		 169 aa  265  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4247  hypothetical protein  72.19 
 
 		 169 aa  258  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3283  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.19 
 
 		 173 aa  219  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0894  hypothetical protein  61.35 
 
 		 180 aa  207  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0838  hypothetical protein  61.35 
 
 		 180 aa  207  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4608  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.25 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.37 
 
 		 182 aa  177  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2937  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  52.87 
 
 		 173 aa  174  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4591  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.08 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.190429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0317  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.77 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0187831  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1314  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.91 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683617  hitchhiker  0.00106774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  47.33 
 
 		 171 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1835  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.59 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0751413  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.82 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.13 
 
 		 170 aa  120  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.49 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.85 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.49 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.71 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  34.84 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40700  hypothetical protein  37.16 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3451  hypothetical protein  36.49 
 
 		 161 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2601  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  35.15 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432616 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.08 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0857  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.15 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4451  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.54 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0780502  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3731  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.27 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  22.29 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002475  putative DNA-binding protein  27.89 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  23.65 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3035  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.17 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2315  hypothetical protein  24.65 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  23.65 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  22.97 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  22.97 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  22.97 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  22.97 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  22.97 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3691  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.32 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  26.5 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>