45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4100 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4100  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 169 aa  346  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3776  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  91.12 
 
 		 169 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0933459  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  73.96 
 
 		 169 aa  263  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4247  hypothetical protein  73.96 
 
 		 169 aa  263  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3283  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.96 
 
 		 173 aa  218  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0894  hypothetical protein  63.19 
 
 		 180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0838  hypothetical protein  63.19 
 
 		 180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4608  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  58.13 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2937  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  56.69 
 
 		 173 aa  183  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.21 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4591  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.05 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.190429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0317  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.77 
 
 		 169 aa  154  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0187831  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  48.67 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1314  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.71 
 
 		 182 aa  138  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683617  hitchhiker  0.00106774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1835  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.87 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0751413  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.85 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.22 
 
 		 169 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.22 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.85 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.08 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  34.16 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40700  hypothetical protein  35.81 
 
 		 165 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3451  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2601  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.94 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432616 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.11 
 
 		 164 aa  87.4  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0857  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.81 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2315  hypothetical protein  27.46 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.48 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3731  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.57 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002475  putative DNA-binding protein  27.89 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  22.64 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  22.97 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4451  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.36 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0780502  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  22.97 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  22.97 
 
 		 159 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  22.97 
 
 		 159 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  22.97 
 
 		 159 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0125  hypothetical protein  21.62 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00974203  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  22.97 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  22.3 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3035  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  22.36 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  22.3 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3691  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.18 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0821  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.36 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.811085  hitchhiker  0.0000000171458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>