51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0151 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 182 aa  360  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4608  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  83.04 
 
 		 172 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4100  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.21 
 
 		 169 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.47 
 
 		 169 aa  178  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3776  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.37 
 
 		 169 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0933459  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3283  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.83 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0894  hypothetical protein  53.01 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0838  hypothetical protein  53.01 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4247  hypothetical protein  53.12 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  52.98 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4591  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.06 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.190429 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2937  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  52.26 
 
 		 173 aa  151  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0317  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50 
 
 		 169 aa  150  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0187831  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1314  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.48 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683617  hitchhiker  0.00106774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1835  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.86 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0751413  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.24 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.63 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.46 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.63 
 
 		 169 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.63 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.54 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40700  hypothetical protein  41.1 
 
 		 165 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3451  hypothetical protein  40.41 
 
 		 161 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.21 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.68 
 
 		 164 aa  84.3  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2601  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36.42 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432616 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0857  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.37 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2315  hypothetical protein  25.97 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0125  hypothetical protein  29.05 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00974203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  32.33 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  29.8 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.81 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  31.58 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002475  putative DNA-binding protein  30.2 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.92 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  24.49 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4451  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.66 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0780502  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0525  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.08 
 
 		 152 aa  47.8  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00173992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1523  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.71 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3035  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  29.06 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1509  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.12 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.710297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0821  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.73 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.811085  hitchhiker  0.0000000171458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.71 
 
 		 154 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3961  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.5 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4802  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  41.79 
 
 		 152 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.576416  normal  0.802544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>