51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40700 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_40700  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  333  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3451  hypothetical protein  99.38 
 
 		 161 aa  322  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  48.65 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0838  hypothetical protein  43.51 
 
 		 180 aa  120  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0894  hypothetical protein  43.51 
 
 		 180 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3283  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.83 
 
 		 173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1314  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.24 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683617  hitchhiker  0.00106774 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0857  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.25 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.53 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3776  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.11 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0933459  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2937  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  41.03 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.67 
 
 		 169 aa  104  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.94 
 
 		 182 aa  103  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4100  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.15 
 
 		 169 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4247  hypothetical protein  36.94 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4608  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.71 
 
 		 172 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.35 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.47 
 
 		 169 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1835  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.12 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0751413  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.71 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4591  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.36 
 
 		 168 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.190429 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.29 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.9 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0317  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.19 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0187831  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.5 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2315  hypothetical protein  32.89 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2601  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  35.85 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432616 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3035  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.22 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4451  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.98 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0780502  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  30.83 
 
 		 159 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2511  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  31.67 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.579279 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  30.83 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1855  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.67 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.157643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  30.83 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.17 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  30.83 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1404  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  30.83 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.812752  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01756  hypothetical protein  30.83 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  30.83 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01744  hypothetical protein  30.83 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  30.83 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  30.83 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1873  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  30.83 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2011  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  30.83 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.111031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1845  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.83 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.900726  normal  0.129019 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2041  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  30.83 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  30 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.83 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1868  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.74 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.11023 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1509  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.04 
 
 		 162 aa  40.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.710297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>