45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3283 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3283  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0894  hypothetical protein  87.28 
 
 
180 aa  310  9e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0838  hypothetical protein  87.28 
 
 
180 aa  310  9e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4247  hypothetical protein  64.63 
 
 
169 aa  226  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.8 
 
 
169 aa  224  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3776  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.19 
 
 
169 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0933459  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4100  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.96 
 
 
169 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4608  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.12 
 
 
172 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.85 
 
 
182 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0317  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.52 
 
 
169 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0187831  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2937  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  46.15 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  50.32 
 
 
171 aa  150  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4591  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.08 
 
 
168 aa  140  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.190429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.05 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.2 
 
 
169 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.01 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1314  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.82 
 
 
182 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683617  hitchhiker  0.00106774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.42 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.64 
 
 
170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1835  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.61 
 
 
167 aa  121  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0751413  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40700  hypothetical protein  42.57 
 
 
165 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3451  hypothetical protein  41.89 
 
 
161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.31 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2601  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  37.42 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432616 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.76 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.33 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0857  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.13 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2315  hypothetical protein  26.58 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4451  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.91 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0780502  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  25.17 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.99 
 
 
158 aa  51.2  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  26.47 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  26.47 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  26.47 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3035  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.48 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  26.47 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  25.52 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  25.17 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  26.47 
 
 
159 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0125  hypothetical protein  26.06 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00974203  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3731  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.96 
 
 
161 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002475  putative DNA-binding protein  30.43 
 
 
160 aa  47.8  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.12 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  26.98 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0821  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.76 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.811085  hitchhiker  0.0000000171458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>