70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0355 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  100 
 
 		 162 aa  333  7e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4247  hypothetical protein  35.48 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3776  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.84 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0933459  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4100  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.16 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.5 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.12 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2937  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  34.62 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.33 
 
 		 171 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40700  hypothetical protein  35.81 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3451  hypothetical protein  35.81 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.9 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1314  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.11 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683617  hitchhiker  0.00106774 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3283  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.76 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0838  hypothetical protein  34.67 
 
 		 180 aa  91.3  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0894  hypothetical protein  34.67 
 
 		 180 aa  91.3  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4608  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.57 
 
 		 172 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.21 
 
 		 182 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2315  hypothetical protein  29.01 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4591  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 		 168 aa  84  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.190429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.93 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1835  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.33 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0751413  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.03 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0857  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.85 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.21 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0317  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.82 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0187831  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  37.24 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  36.81 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  36.81 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  36.81 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  37.24 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  36.81 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  36.55 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0125  hypothetical protein  33.12 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00974203  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  36.81 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4451  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.11 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0780502  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.64 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.03 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2601  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.33 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432616 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 564 aa  50.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1215  hypothetical protein  31.37 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2116  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.43 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0022261  decreased coverage  0.00203199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3035  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.6 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3384  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.62 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1209  hypothetical protein  30.39 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1374  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  23.61 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.734452  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1914  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.23 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2074  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  23.6 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328816 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 		 577 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002475  putative DNA-binding protein  32.22 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1408  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  23.6 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.247573 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 577 aa  44.7  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1391  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  23.6 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000245761 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01756  hypothetical protein  25.35 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01744  hypothetical protein  25.35 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1756  hypothetical protein  29.81 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1873  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  25.35 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2041  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  25.35 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1845  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.35 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.900726  normal  0.129019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1404  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  25.35 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.812752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1894  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  23.6 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  27.47 
 
 		 574 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0821  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.51 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.811085  hitchhiker  0.0000000171458 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1791  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.73 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2511  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  24.65 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.579279 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0303  hypothetical protein  25.49 
 
 		 161 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000014956  unclonable  0.000000628456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1855  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.65 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.157643  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2011  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  24.65 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.111031  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2082  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.68 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>