37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2937 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2937  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  100 
 
 
173 aa  349  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4591  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.14 
 
 
168 aa  192  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.190429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4100  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.69 
 
 
169 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3776  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.87 
 
 
169 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0933459  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4247  hypothetical protein  51.61 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0894  hypothetical protein  49.4 
 
 
180 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0838  hypothetical protein  49.4 
 
 
180 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.74 
 
 
169 aa  157  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1314  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50 
 
 
182 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683617  hitchhiker  0.00106774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4608  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.8 
 
 
172 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3283  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.15 
 
 
173 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.26 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  46.63 
 
 
171 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0317  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50 
 
 
169 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0187831  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1835  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.87 
 
 
167 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0751413  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.32 
 
 
158 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40700  hypothetical protein  40.82 
 
 
165 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3451  hypothetical protein  40.14 
 
 
161 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.07 
 
 
175 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.89 
 
 
169 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.27 
 
 
169 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.41 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  34.62 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.5 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.41 
 
 
164 aa  84.3  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2601  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  37.97 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432616 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0857  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.19 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2315  hypothetical protein  24.34 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4451  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.43 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0780502  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3035  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.26 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  24.22 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  24.22 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  24.22 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.74 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.433754  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  24.22 
 
 
159 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  24.22 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  24.22 
 
 
159 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>