41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1835 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1835  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 167 aa  327  6e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0751413  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4100  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.87 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.59 
 
 		 169 aa  131  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3776  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.59 
 
 		 169 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0933459  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4608  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.12 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.95 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.41 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.03 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.06 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2937  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  39.87 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  43.92 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3283  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.61 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4247  hypothetical protein  40.37 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0317  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.86 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0187831  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0838  hypothetical protein  43.62 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0894  hypothetical protein  43.62 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.21 
 
 		 170 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4591  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.41 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.190429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.86 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1314  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.13 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683617  hitchhiker  0.00106774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.72 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2601  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  38.06 
 
 		 176 aa  88.2  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432616 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.66 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.33 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40700  hypothetical protein  31.62 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3451  hypothetical protein  30.88 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2315  hypothetical protein  25.77 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0857  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.59 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002475  putative DNA-binding protein  31.91 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00130  hypothetical protein  29.75 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3035  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.84 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4451  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.36 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0780502  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  23.44 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  29.21 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  35.38 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.25 
 
 		 161 aa  42  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  23.08 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  22.92 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1523  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.57 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>