44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4608 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4608  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 172 aa  336  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  84.76 
 
 		 182 aa  278  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4100  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  58.13 
 
 		 169 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3776  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.25 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0933459  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.66 
 
 		 169 aa  180  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3283  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.12 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0894  hypothetical protein  54.09 
 
 		 180 aa  168  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4247  hypothetical protein  54.09 
 
 		 169 aa  168  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0838  hypothetical protein  54.09 
 
 		 180 aa  168  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  52.38 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2937  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  53.46 
 
 		 173 aa  155  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4591  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.72 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.190429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1314  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.81 
 
 		 182 aa  147  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683617  hitchhiker  0.00106774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0317  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50 
 
 		 169 aa  143  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0187831  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1835  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.12 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0751413  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.37 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.75 
 
 		 169 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.98 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.75 
 
 		 169 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.25 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.44 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40700  hypothetical protein  38.36 
 
 		 165 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3451  hypothetical protein  37.67 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.57 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.03 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0857  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.57 
 
 		 154 aa  85.9  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2601  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.54 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432616 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2315  hypothetical protein  24.68 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  28.46 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0125  hypothetical protein  25.68 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00974203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  26.35 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  27.69 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  27.69 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  27.69 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  27.69 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  27.69 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  27.69 
 
 		 159 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  24.49 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  23.65 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.74 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4451  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.42 
 
 		 179 aa  48.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0780502  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002475  putative DNA-binding protein  28.77 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3035  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  22.93 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000118066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>