45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0894 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0894  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0838  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3283  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  87.28 
 
 		 173 aa  310  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4247  hypothetical protein  64.85 
 
 		 169 aa  223  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.19 
 
 		 169 aa  217  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4100  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.19 
 
 		 169 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3776  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.35 
 
 		 169 aa  207  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0933459  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0317  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.42 
 
 		 169 aa  174  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0187831  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.37 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4608  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.09 
 
 		 172 aa  168  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2937  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  49.68 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  52.23 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4591  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.67 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.190429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.92 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.72 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1314  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.51 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683617  hitchhiker  0.00106774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.72 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.26 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1835  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.62 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0751413  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40700  hypothetical protein  43.24 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3451  hypothetical protein  42.57 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.85 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  34.67 
 
 		 162 aa  91.3  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.38 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2601  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36.14 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432616 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0857  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.79 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2315  hypothetical protein  27.5 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.68 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  28.67 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  28.67 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  28.67 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  28.67 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  28.67 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0125  hypothetical protein  28.67 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00974203  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  28.67 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  27.97 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.4 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  27.97 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4451  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.89 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0780502  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3035  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.83 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002475  putative DNA-binding protein  32.56 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3731  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.29 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0821  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.35 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.811085  hitchhiker  0.0000000171458 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  26.19 
 
 		 156 aa  42  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>