More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2094 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 174 aa  338  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00130  hypothetical protein  68.87 
 
 		 159 aa  197  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01130  hypothetical protein  65.56 
 
 		 153 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  64 
 
 		 172 aa  172  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.433754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1027  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  70.42 
 
 		 167 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278653  normal  0.0205015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.86 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375974  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.61 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.67 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5579  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.43 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.64 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  26.39 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  27.91 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  32.26 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3691  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.85 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  32.61 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  32.14 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  31.52 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  31.45 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  30.07 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  31.45 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  30.65 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  29.66 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  31.45 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  31.45 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  30.65 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  31.54 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  34 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.2 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  32.48 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  30.71 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  29.75 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  30.71 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  34.17 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  30.65 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  30.65 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  29.87 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  28.85 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  30.33 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.31 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  29.37 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  29.53 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  34.4 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  30.57 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  32.28 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  29.53 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.53 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  29.51 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  29.94 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  32.12 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  27.42 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  30.53 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  30.5 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  30.53 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  30.41 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  34.51 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  26.32 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  31.62 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  30.4 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  30.4 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  30.4 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  31.21 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  28.68 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  30.22 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  30.4 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  30.4 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  30.4 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  30.4 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  25.48 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  29.87 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.66 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  32.09 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  32.69 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  25.17 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  29.01 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  28.69 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.81 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  28.21 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  33.06 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  25.2 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  27.27 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  34.64 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  30.16 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  30.36 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  30.97 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  27.92 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2187  hypothetical protein  28.46 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  30.16 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.25 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  29.03 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1029  hypothetical protein  33.06 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  30.97 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  32.26 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  31.53 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  34.23 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.03 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  29.49 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  30.97 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  30.97 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>