230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1027 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1027  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 167 aa  324  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278653  normal  0.0205015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01130  hypothetical protein  70.95 
 
 		 153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00130  hypothetical protein  65.36 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  70.42 
 
 		 174 aa  181  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  68.83 
 
 		 172 aa  180  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.433754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.22 
 
 		 161 aa  174  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.79 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5579  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.85 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.19 
 
 		 171 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  30.23 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  28.37 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  33.11 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.92 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  28.46 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  36.79 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3691  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.45 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  30.56 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  36.59 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  33.64 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  34.58 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  28.48 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  30.97 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  30.88 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  26.28 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  32.41 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  27.59 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  31.15 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  34.91 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  33.59 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0821  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.54 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.811085  hitchhiker  0.0000000171458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  27.42 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  32.09 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  29.6 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  27.42 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  31.36 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.27 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 576 aa  51.6  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  26.92 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.66 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  28.23 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  31.16 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.01 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  28.83 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  31.34 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  31.34 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 		 564 aa  50.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  30.51 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  27.42 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  31.34 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  32.41 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.21 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  31.34 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.34 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.34 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  31.34 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  30.51 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  27.42 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4290  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.93 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000309077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  32.2 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  31.86 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2082  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.13 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0762235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  28 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  28.23 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02710  hypothetical protein  33.87 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0577764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3500  ybaK/ebsC protein  27.42 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00301765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.93 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  26.79 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  27.27 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  26.79 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  28.95 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  31.79 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4739  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.21 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  27.42 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  29.73 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  30.63 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  27.34 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  31.78 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1215  hypothetical protein  23.7 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  29.51 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  30.63 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  29.91 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 566 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  27.46 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  36.46 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3822  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.68 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.808721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  29.61 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  22.15 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0303  hypothetical protein  24.83 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000014956  unclonable  0.000000628456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  32.63 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 570 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  25.51 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  27.97 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  27.42 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  27.42 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  31.96 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0808  prolyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 565 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000617993  hitchhiker  0.000236746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>