233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01130 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01130  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  297  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00130  hypothetical protein  62.58 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1027  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  70.71 
 
 		 167 aa  178  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278653  normal  0.0205015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.5 
 
 		 172 aa  172  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.433754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.03 
 
 		 174 aa  170  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.77 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.7 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5579  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.82 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.69 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  28.35 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  28.68 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  32.62 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.26 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  34.62 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  29.03 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  31.36 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  35.76 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  31.62 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  33.57 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  32.2 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  31.36 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  30.26 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  32.79 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  31.5 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  27.42 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  30.56 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  22.29 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.44 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  28.23 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  34.83 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  31.13 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  34.83 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  26.9 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  34.83 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  31.75 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  31.15 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  34.83 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  34.83 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  28.23 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  34.83 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  34.83 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  34.83 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  33.12 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  30.51 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  30.87 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  30.08 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  30.6 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  32.2 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  29.63 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  40.16 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  28.23 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  34.21 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  28.23 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  35.23 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  32.2 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  29.91 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  28.93 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  36.9 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  29.63 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  29.63 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  35.23 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  27.97 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  36.9 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  31.09 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.91 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  32.74 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  29.06 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  29.23 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 574 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  31.11 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  29.06 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  34.12 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0466  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.86 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  30.15 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  36.36 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 564 aa  51.2  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  24.79 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  33.61 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  29.41 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  27.5 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4290  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.25 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000309077  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.57 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  29.71 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.27 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0113  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.41 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0260  hypothetical protein  35.85 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  27.27 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  30.07 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.03 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  30.43 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.83 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.91 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3353  hypothetical protein  39.76 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 		 570 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  26.85 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>