254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0161 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.25 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  32.74 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  26.76 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  28.12 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  28.24 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  26.25 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  26.25 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.96 
 
 
171 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0762235  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  26.58 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  28.48 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  26.58 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  28.48 
 
 
156 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  27.5 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  26.25 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  26.58 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0466  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.36 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  25.62 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.03 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.66 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  27.85 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  25.62 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8118  hypothetical protein  44.59 
 
 
173 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564267  normal  0.663077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02510  hypothetical protein  31.13 
 
 
181 aa  57.8  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0689687  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0303  hypothetical protein  30.2 
 
 
152 aa  57.8  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02710  hypothetical protein  42.67 
 
 
180 aa  57.4  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0577764  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  25 
 
 
158 aa  57.4  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 
578 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  25 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1212  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.82 
 
 
151 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0760914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  25.32 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  24.66 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  24.38 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  25.62 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6129  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.4 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.684201  normal  0.245919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  27.89 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0327  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.85 
 
 
160 aa  54.3  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.71 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  26.49 
 
 
157 aa  53.9  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  27.33 
 
 
159 aa  53.9  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6541  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.2 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.361078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3551  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.27 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0146665  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.23 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  26.25 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0561  hypothetical protein  29.55 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.155042  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 
582 aa  53.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  26.25 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1617  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.73 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1868  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.31 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.11023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  26.25 
 
 
159 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  26.25 
 
 
159 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  26.25 
 
 
159 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  24.67 
 
 
159 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  26.25 
 
 
159 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 
572 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  24.67 
 
 
159 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  24.67 
 
 
159 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4290  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.46 
 
 
152 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000309077  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  24.67 
 
 
159 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  26.25 
 
 
159 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3243  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.67 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156466  normal  0.0643244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  24.67 
 
 
159 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4342  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.47 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.519353 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  26.25 
 
 
159 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.53 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0019  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.18 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  23.48 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0591  hypothetical protein  34.69 
 
 
180 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  24.05 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 
577 aa  51.6  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  19.64 
 
 
158 aa  50.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 
577 aa  50.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  25 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  20.95 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3021  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.07 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00107771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  25.4 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2041  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  30.53 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  25.62 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.38 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1653  putative ybaK-like protein  31.86 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  26.56 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 
576 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  21.1 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  23.42 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2174  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.34 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000343666 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0132  hypothetical protein  26.39 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  28.35 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  25.62 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0899  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.13 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0968  hypothetical protein  29.73 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.107423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0548  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.43 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0872  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.56 
 
 
231 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497961  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2011  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  29.47 
 
 
167 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.111031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  25.24 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01756  hypothetical protein  29.47 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1855  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.47 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.157643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1845  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.47 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.900726  normal  0.129019 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0247  prolyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 
620 aa  48.1  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>