48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8118 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8118  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  340  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564267  normal  0.663077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  69.82 
 
 		 171 aa  222  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0762235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0034  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  73.78 
 
 		 172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.510186  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4145  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  71.26 
 
 		 173 aa  218  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.704606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02510  hypothetical protein  64.07 
 
 		 181 aa  207  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0689687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1697  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.57 
 
 		 177 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1719  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.57 
 
 		 177 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.325285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1765  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.57 
 
 		 177 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.561232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0591  hypothetical protein  70.21 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6768  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  68.05 
 
 		 184 aa  194  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560351  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4342  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.36 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.519353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8692  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  67.07 
 
 		 180 aa  177  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.88 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0451372  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4973  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  64.71 
 
 		 183 aa  174  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0872  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  66.07 
 
 		 231 aa  171  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497961  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02710  hypothetical protein  57.56 
 
 		 180 aa  170  7.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0577764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3610  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.12 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2291  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.43 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1617  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.62 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.12 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21350  hypothetical protein  48.02 
 
 		 210 aa  140  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.358987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1438  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.07 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34850  putative tRNA synthase  47.47 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00137081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4449  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.88 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000475231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0770  hypothetical protein  43.17 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.74 
 
 		 127 aa  89  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.59 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3220  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.32 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000408202  normal  0.0156716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2948  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.76 
 
 		 103 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  25.95 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.96 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  32.98 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  26.32 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  30.99 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  33.73 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  24.05 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  33.85 
 
 		 157 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0548  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.34 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  31.67 
 
 		 157 aa  42  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0284  putative ebsC protein  26.98 
 
 		 160 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.663414  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0881  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  26.98 
 
 		 202 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623093  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1464  putative ebsC protein  26.98 
 
 		 151 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1661  putative ebsC protein  26.98 
 
 		 151 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2579  YbaK  26.98 
 
 		 151 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508763  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2443  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  26.98 
 
 		 151 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0316  putative ebsC protein  26.98 
 
 		 151 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1624  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.98 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>