48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1697 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1697  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
177 aa  355  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158156  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1719  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  96.61 
 
 
177 aa  344  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.325285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1765  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  96.61 
 
 
177 aa  344  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.561232  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8118  hypothetical protein  60.57 
 
 
173 aa  197  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564267  normal  0.663077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.52 
 
 
171 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0762235  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02510  hypothetical protein  58.93 
 
 
181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0689687  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4145  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.73 
 
 
173 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.704606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0591  hypothetical protein  65.22 
 
 
180 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6768  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  64.71 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560351  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0034  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.510186  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.73 
 
 
182 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0451372  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4342  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.66 
 
 
184 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.519353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02710  hypothetical protein  53.53 
 
 
180 aa  164  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0577764  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8692  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.24 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4973  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.43 
 
 
183 aa  155  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1617  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.71 
 
 
186 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0872  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.98 
 
 
231 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3610  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.87 
 
 
180 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2291  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.43 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0770  hypothetical protein  46.85 
 
 
179 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4449  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.76 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000475231  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34850  putative tRNA synthase  47.01 
 
 
180 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00137081  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1438  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.07 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.61 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21350  hypothetical protein  44.37 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.358987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.11 
 
 
127 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  31.68 
 
 
155 aa  54.3  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  27.63 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.12 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  35 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  23.53 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2948  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.92 
 
 
103 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  28 
 
 
157 aa  44.3  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5579  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.29 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.94 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  23.66 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.47 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  31.58 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  25 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  26.76 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  27.63 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  26.09 
 
 
163 aa  41.6  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  21.33 
 
 
160 aa  41.6  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  21.33 
 
 
160 aa  41.6  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-like protein  28.28 
 
 
162 aa  41.2  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.702018  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.84 
 
 
174 aa  40.8  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  34 
 
 
162 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>