62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4449 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4449  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000475231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0770  hypothetical protein  89.94 
 
 		 179 aa  330  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34850  putative tRNA synthase  63.69 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00137081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  72.5 
 
 		 127 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1697  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.76 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1719  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.76 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.325285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1765  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.76 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.561232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.85 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0451372  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0591  hypothetical protein  41.13 
 
 		 180 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.22 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0762235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8118  hypothetical protein  43.88 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564267  normal  0.663077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4342  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.88 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.519353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4145  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.12 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.704606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0034  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.88 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.510186  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6768  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.34 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02510  hypothetical protein  40.88 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0689687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3610  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.01 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0872  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.17 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497961  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1617  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.14 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2291  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.1 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02710  hypothetical protein  41.79 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0577764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4973  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.41 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8692  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.15 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1438  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.46 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21350  hypothetical protein  37.14 
 
 		 210 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.358987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.12 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2948  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.16 
 
 		 103 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  32 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  32.35 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  32.35 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  34.85 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  29.08 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.65 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3470  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.88 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.116245  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1416  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.84 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  34.85 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3243  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.43 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156466  normal  0.0643244 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  25.19 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  31.82 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5549  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.54 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  31.08 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  31.82 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  31.82 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  31.82 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.82 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  31.82 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  30.3 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.82 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  31.82 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  31.82 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  31.82 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0686  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.35 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  31.18 
 
 		 169 aa  41.6  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  30.3 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  27.78 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0316  putative ebsC protein  27.97 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129099  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1464  putative ebsC protein  27.97 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1661  putative ebsC protein  27.97 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2579  YbaK  27.97 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508763  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2443  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  27.97 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0284  putative ebsC protein  27.97 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.663414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>